Томская область входит в топ-10 инновационных регионов России. Помимо мощного университетского научного комплекса здесь расположены научные центры СО РАН и СО РАМН и реализуется проект особой экономической зоны технико-внедренческого типа. В городе часто проводятся крупные научные форумы, например U-NOVUS и «Недели науки», в рамках которых ведущие ученые России и мира читают открытые лекции, проходят тематические выставки, и свои двери для экскурсий открывают научные лаборатории, презентующие новейшие разработки.
В Томске находится один из мощнейших инновационных кластеров не только в Сибири, но и во всей России. Поэтому главные достижения Томской области связаны, как правило, либо с научными открытиями, либо с промышленным внедрением инновационных разработок.